长华科技主要以自来水作为湿制程（电镀）、洗净与环保之用途，各厂取水来源皆来自第三方供水之地表水，取水来源均为淡水（≤1,000mg/L 总溶解固体），台湾厂区供水来源为台湾自来水公司之高屏堰、南化联管及凤山水库、大陆厂区供水来源分别为岷江及太湖、海外厂区供水来源为雪兰莪河，所有原水水源均未被划分为国家或国际自然保护区，非来自敏感的水体；另参照AQUEDUCT WATER RISK ATLAS评估各厂区之水资源风险评估结果，显示大陆厂判定等级「High-Medium risk (3-4)」属有水源压力地区，其余各据点均为不具水源压力之地区，其等级为 「Low-Medium risk (1-2)」。
长华科技主要以自来水作为湿制程（电镀）、洗净与环保之用途，面对近年来全球气候变迁，为确保厂区不因水资源匮乏造成立即性的缺水危机，公司持续落实监控用水量并积极推动厂区节水措施。台湾厂区于2021年开始增设制程回收系统，针对含有高酸性浓度的水洗水经过处理过滤再利用，取代原先直接经废水处理厂处理后放流，提高制程废水回用率，并配合各项节水措施降低水资源的耗用。此外，公司持续关注政府水情信息，于缺水或限水期间将依水情状况优先降低非必要用水，并提高制程回收水使用比例，以降低限水对生产营运之影响，维持厂区供水及生产运作稳定。
2025年因产能提升带动取水量增加至1,491百万公升（+8.36%），惟增幅低于产量成长幅度（+9.88%），显示用水效率持续改善；取水回收率亦由27.69%提升至27.83%，展现节水管理成效。
台湾厂区于2021年增建制程水薄膜过滤回收系统，利用超过滤（Ultra Filtration, UF）搭配逆渗透（Reverese Osmosis, RO）处理制程排水回收利用；于2022年起续投入薄膜过滤（Membrane Bio Reactor, MBR；Membrane Chemical Reactor, MCR）设备替代UF系统放大过滤孔径增加膜通量改善阻塞问题以提高水回收系统效率，同时亦可减少逆洗、药洗频率降低回收水消耗，此外减少更换滤袋流程亦达成减废成效。 2022年起陆续增设MBR系统，并于2025完成第三套MBR系统的增设，每日回收水的量从2023年的170吨、2024年的每日181吨，于2025年每日平均已可回收224吨至工业水池，效果显著，并计划于2026年增设第四套MBR系统。
台湾厂区已于2021年增建制程纯水回收系统，透过纯水RO逆渗透系统所产生的浓缩水台湾厂区已于2021年增建制程纯水回收系统，透过纯水RO逆渗透系统所产生的浓缩水通过二次RRO系统进行回收，以供制程使用。由于RO纯水系统设计经过2B3T前处理，使得二次RRO系统产生的浓缩水质量甚至优于自来水，因此将其导入工业水池回收循环使用。2025年台湾厂区纯水制程回收水量合计为82,867吨，占用总水量11.4%。
电镀机台使采用多段逆流水洗设计，这使得一道水可以在三道水洗槽中循环使用，达到节水设计。
公司每年都会定期进行采样与检测放流水各项数据，以确保制程产生的废水完全符合现行环保法规范及园区纳管标准，以降低对环境的污染冲击。公司积极针对厂区废水污染防治系统进行检讨及改善，2025年各生产工厂放流水质检测结果均维持符合所在地法规核可标准(注)。 注：台湾厂区系依照《高雄楠梓科技产业园区污水下水道纳管水质标准》，大陆厂区系依照中国《污水综合排放标准》及《污水排入城镇下水道水质标准》及《电镀污染物排放标准》，海外厂区系依照马来西亚《Enviroment Quality Act 1974》。